الدرس الثالث | تحميل ملفات قراءات الجينوم من قواعد البيانات

📈 مستوى الدرس: مبتدئ.

⏱ مدة الدرس التقريبية: ساعة. 

💻 المتطلبات: أي واجهة أوامر على أي نظام.

💡 المخرجات المتوقعة:
1️⃣ تعلم الفرق بين ملفات Fasta، وملفات Fastq.

2️⃣ فهم طريقة البحث في SRA والفرق بين رموز البيانات.

    3️⃣ تحميل ملفات Fastq من قاعدة بيانات SRA باستخدام واجهة الأوامر.

السلام عليكم ورحمة الله وبركاته

في هذا الدرس نتعلم الفرق بين ملفات Fasta وملفات Fastq.

وكيفية الحصول على قراءات جينية لمختلف الكائنات، والأمراض، والأنسجة، من قاعدة بيانات Sequence Read Archive (SRA).

ثم نشرح كيفية تحميل ملفات القراءات الجينية مباشرة من قاعدة البيانات إلى الحاسب باستخدام SRA toolkit.